Зачёт НДФЛ при переквалификации договоров с самозанятыми

В последнее время участились случаи переквалификации налоговыми органами договоров ГПХ, заключённых с самозанятыми, в трудовые договоры. Для работодателя это означает доначисление НДФЛ и страховых вносов, поскольку заплатить неудержанные суммы НДФЛ, выявленные по результатам налоговой проверки, должен заказчик — как налоговый агент (п. 10 ст. 226 НК РФ).

И здесь возникает вопрос о возможности частичного зачёта сумм НПД, которые уже заплатил в бюджет самозанятый, в счёт сумм НДФЛ, которые теперь должен заплатить заказчик.

Этот вопрос в своё время рассматривался Верховным судом РФ[1], который указал, что переплата, возникшая в результате переквалификации договорных отношений из гражданско-правовых в трудовые, находится в распоряжении работника и подлежит возврату только по его заявлению. Если такого волеизъявления нет, то и переплата не может быть зачтена в счёт уплаты НДФЛ. Однако осталось непонятным, как на практике можно реализовать зачёт НПД в счёт НДФЛ и каким образом должно быть выражено волеизъявление, если оно всё-таки есть, на что мы указывали ранее[2].

Сейчас этот вопрос начал решаться на практике.

Например, в постановлении Арбитражного суда Уральского округа от 08.04.2026 № Ф09-407/26 также отмечено, что налоги, уплаченные самозанятыми, могут быть скорректированы лишь ими самими — в случае возврата средств за товары, работы, услуги или при исправлении некорректных данных. Возникшая в результате корректировки переплата (положительное сальдо ЕНС) находится в распоряжении физического лица и только по его заявлению подлежит возврату или может быть зачтена в счёт исполнения обязательств налогового агента.

Однако в период рассмотрения этого судебного спора налоговый орган направил самозанятым информационные письма об ошибочном исчислении ими НПД и возникновении у них переплаты по этому налогу. Те в ответ попросили направить эти суммы в счёт уплаты НДФЛ, доначисленного фактическому работодателю по итогам налоговой проверки. Приняв во внимание их волеизъявление, суд согласился уменьшить сумму НДФЛ, доначисленного налоговому агенту по итогам налоговой проверки, на сумму самостоятельно исчисленного физическими лицами и уплаченного НПД.  

Узнайте больше о наших услугах налогового консультирования

[1] Определение Судебной коллегии по экономическим спорам Верховного Суда Российской Федерации от 03.02.2025 № 309-ЭС24-20306 по делу № А76-20897/2023.

[2] Зачёт налогов при переквалификации самозанятых в работники